القسم مجهز جيدا بالأجهزة والمعدات البحثية الحديثة. ويتم شراء المواد الكيميائية لكل مشروع بحثي قائم. وترعى تمويل المشاريع البحثية الهيئة السعودية للأبحاث العلمية ومدينة MSMS (اجيلنت)، جهاز كروماتوجرافيا الغاز كلاروس 5000 (بيركن إلمر)، جهاز كروماتوجرافيا الطبقة الرقبقة عالية الكفاءة - DAD-FLD (Waters 2695 Alliance System) ، UPLC - UPLC-MS Triple Quad (Agilent), ICP-MS Speciation system (Agilent), FT-IR (GX Perkin Elmer), Atomic Absorption Spectrometer (Perkin Elmer) جنبا إلى جنب مع غيرها من المرافق المفيدة (مطياف الأشعة فوق البنفسجية، معمل التلألأ من جراء التعرض للضوء، التجميد الجاف - الفراغ من المسيح، وجهاز للطرد المركزي المبردة، و مقياس درجة الحموضة، معاير كارل فيشر) المتعلقة بالتشييد الكيميائي، وتحليل وتصميم الدراسات الحاسوبية للأدوية، وإجراء البحوث في مجال تصميم وتركيب عوامل علاجية جديدة. وتقدم هذه المعامل لطلاب الدراسات العليا مع سهولة الوصول إلى هذه المعامل في جميع أنحاء دراساتهم العلمية في برنامج البحوث.

الأنشطة البحثية لأعضاء هيئة التدريس في قسم المنتجات الطبيعية والطب البديل هي موجهة أساسا للمجالات التالية : فصل المركبات النشطة بيولوجيا باستخدام تقنيات الكروماتوجرافيا المختلفة واستجلاء تركيبها البنائى باستخدام طرق كيميائية مختلفة والوسائل الطيفية (مثل طيف الكتلة وطيف الرنين المغناطيسي النووي).

• -دراسة النباتات الطبية السعودية من حيث تاثيرها على، الاورام، , فيروس نقص المناعة البشرية مرض السكر، ، ومضادات الأكسدة والقلب
• -مراقبة الجودة للمنتجات العشبية
• -اكتشاف أدوية جديدة من الكائنات البحرية في البحر الأحمر
• -التكنولوجيا الحيوية البحرية وزراعة الأنسجة النباتية
• -السموم البحرية
• -التخليق النصفى للمنتجات الطبيعية البحرية
• -البيئة البحرية والدفاع الكيميائى في اللافقاريات البحرية
• -التحول الميكروبيولوجى
• -التكافل في اللافقاريات البحرية
• -الفطريات البحرية والأكتينوميسيتات كمصدر للادوية الجديدة